Αρχαία ακρόπολη που παρέμεινε ενεργή μέχρι την περίοδο της ενετοκρατίας, η ακρόπολη της Αρκεσίνης βρίσκεται σε χαρακτηριστικό βραχώδη λόφο, πάνω από τη θάλασσα, βόρεια από το χωριό Βρούτσης ή Βρουτσί της «Κάτω Μεριάς» της Αμοργού, δηλαδή στο νοτιοδυτικό σκέλος του νησιού. Στο βράχο της ακρόπολης έχουν εντοπιστεί ίχνη μεσοκυκλαδικής εγκατάστασης καθώς και ευρήματα ιστορικών χρόνων όπως επιγραφές, γλυπτά, κεραμικά κ.λ.π., τα οποία καλύπτουν μια μεγάλη περίοδο από τη γεωμετρική μέχρι την ρωμαϊκή εποχή. Στην αρχαία Αρκεσίνη βρέθηκε και ο λεγόμενος «θησαυρός της Αρκεσίνης» με βυζαντινά νομίσματα

Βρίσκεται στο Σκευοφυλάκιο πλάι στην είσοδο της μονής της Χοζοβιώτισσας, σε υποβλητικές θολωτές αίθουσες και εγκαινιάστηκε το 2007. Περιλαμβάνει δείγματα της βυζαντινής και μεταβυζαντινής εκκλησιαστικής τέχνης: φορητές εικόνες, λειτουργικά και ιερατικά άμφια, ξυλόγλυπτοι σταυροί, ευαγγέλια, δισκοπότηρα, δισκάρια, κοχλιάρια, καθώς και πλήθος άλλων χρηστικών αντικειμένων και αφιερωμάτων. Ξεχωρίζει σε ειδικό χώρο, το Ευαγγελιστάριο του 11ου αιώνα με 6 μικρογραφίες. Ονομαστή είναι η συλλογή χειρογράφων του μοναστηριού, που αριθμεί περί τους εκατό κώδικες από τον 10ο έως τον 18ο αιώνα.